Clary is een doodgewoon meisje uit New York, totdat haar moeder Jocelyn plotseling verdwijnt. Ze komt tot de schokkende ontdekking dat Jocelyn een prominente demonenjager is. Al snel blijkt dat ook Clary speciale krachten heeft. Samen met de sexy Jace en Simon beweegt ze hemel en aarde om haar moeder terug te halen uit een mysterieuze schaduwwereld.

City of Bones is het eerste deel uit de Mortal Instruments-filmreeks, gebaseerd op de gelijknamige bestsellers van Cassandra Clare.